TMT (Q)
Overview
串联质谱标签 (TMT) 是一种同量异序化学标签,为相对蛋白质组学定量分析提 供了多通路功能。它能对多个样品并行执行质谱法 (MS) 分析,从而增加了通 量,并且能够同时对最多达 18 个不同的细胞、组织或生物体液样品进行相对 定量分析。标签由 MS/MS 报告基团、间隔臂和胺反应性基团组成。在标记期 间,胺反应性基团结合到肽的 N 末端或赖氨酸残基。
在相对定量分析实验中,不同的同量异位标签被用来标记不同的系统条件。标 记之后,混合所有样品并在单个液相色谱-质谱 (LC-MS) 实验中进行分析。同 量异位标签具有相同的化学性质,因此在 LC 分离过程中,来自不同 TMT 标记 样品的所有肽都会发生共洗脱。这些肽进入质谱仪后,就会同时被检测为单个 且不可区分的前体离子峰。碎裂之后,各个系统条件的标签将在 MS/MS 谱的低 m/z 区生成一个具有独特特征的报告离子。蛋白质鉴定是通过将产生的碎片离 子峰与片段数据库中提供的离子峰进行匹配来实现的。通过比较报告离子的强 度即可完成肽类定量分析。
Technical process

提取蛋白后采用高特异性 Trypsin,LysC 等蛋白酶进行酶切反应获取 peptide 混 合物。对同一批待检测样本进行 TMT 标记,完成标记后采用 Nano LC-MS/MS 获 取高质量谱图。再使用专用软件对质谱数据进行 database search,并利用 MS/MS 谱图结果进行定量分析,最后依据实验样本、实验目的等进行生物信息学分析。

Steps Involved
  • 技术支持人员确认需求
  • 样本寄送
  • 酶切实验
  • 质谱检测
  • 数据分析
  • 出具报告

项目交付周期为14 - 21 个工作日

Sample requirement
蛋白溶液形式:蛋白量不低于 50 μg,浓度不低于 0.5μg/μL,溶液不能含有NP40, Triton, X-100等去污剂。
组织、细胞、体液、粪便等其他样本形式请咨询技术人员。
Deliverables
出具正式报告,报告实验过程、PTMs 类型位点修饰比例等信息,依据实验目的可提供包括 Peptide mapping、差异表达分析、Gene Ontology、protein-protein interaction 以及 KEGG pathway 等各种定制化分析结果。
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